Сжатые файлы

Используйте пакеты для чтения и записи.

# gzip compression
import gzip

with gzip.open('somefile.gz', 'rt') as fin:
    text = fin.read()

with gzip.open('otherfile.gz', 'wt') as fout:
    fout.write(text)

При этом выполняется кодирование/декодирование юникода. Если хотите писать как есть, используйте бинарную моду 'rb' и 'wb'.